MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006366	TCAT	2	8	119	126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006366	A	8	8	144	151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006366	ATA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006366	AG	3	6	2752	2757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006366	CTG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006366	AT	3	6	2861	2866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006366	TAT	2	6	2909	2914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006366	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006366	A	7	7	2934	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006366	TTA	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006366	AAT	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006366	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006366	AGGAT	2	10	3021	3030	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006366	TTAA	2	8	5539	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006366	T	6	6	5643	5648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006366	TAT	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006366	TAT	2	6	5697	5702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006366	TTTA	2	8	5743	5750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006366	ATT	3	9	5804	5812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006366	TTAA	2	8	5883	5890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006366	GCT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006366	GTT	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006366	CAC	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006366	ATAA	2	8	8409	8416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006366	TA	4	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006366	TA	3	6	8432	8437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006366	T	6	6	11839	11844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006366	T	6	6	11849	11854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006366	ATG	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006366	AAT	2	6	12149	12154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006366	AGA	2	6	12159	12164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006366	TAA	2	6	12398	12403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006366	A	6	6	12402	12407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006366	ATA	2	6	12460	12465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006366	TAA	2	6	13250	13255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006366	GGA	2	6	13623	13628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006366	GA	3	6	13932	13937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006366	TTG	2	6	16594	16599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006366	GTT	2	6	16684	16689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006366	TGA	2	6	16727	16732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006366	CAA	2	6	16741	16746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006366	ATG	2	6	16761	16766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006366	ATA	2	6	16777	16782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006366	CAAA	2	8	16808	16815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006366	GGA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006366	A	6	6	29587	29592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006366	AGG	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006366	ATT	2	6	34838	34843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006366	A	7	7	34890	34896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006366	TAAA	2	8	34923	34930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006366	ATG	2	6	34952	34957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006366	GT	3	6	34964	34969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006366	TGTTT	2	10	34989	34998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006366	TGAT	2	8	35067	35074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006366	TGT	2	6	35086	35091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006366	AAG	2	6	35117	35122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006366	TGA	2	6	35181	35186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006366	ATAAAC	2	12	35247	35258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006366	AATT	2	8	35286	35293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006366	TAT	2	6	35928	35933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006366	AC	3	6	35934	35939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006366	AC	3	6	35943	35948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006366	ATA	2	6	36255	36260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006366	TTAA	2	8	36272	36279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006366	T	8	8	36326	36333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006366	T	8	8	36336	36343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006366	TTA	2	6	36419	36424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006366	T	7	7	36441	36447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006366	AG	3	6	36564	36569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006366	A	6	6	36597	36602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006366	AG	3	6	36646	36651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006366	T	7	7	36655	36661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006366	AT	3	6	36689	36694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006366	AAC	2	6	36703	36708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006366	A	7	7	37810	37816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006366	ACT	2	6	37865	37870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006366	TGA	3	9	37881	37889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006366	GCT	2	6	37900	37905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006366	TGT	2	6	38135	38140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006366	CATC	2	8	38149	38156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006366	AGT	2	6	38213	38218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006366	T	7	7	38244	38250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006366	AGG	2	6	38275	38280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006366	ATT	2	6	38336	38341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006366	GT	3	6	38362	38367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006366	TTA	3	9	38455	38463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006366	AC	3	6	38490	38495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006366	A	7	7	38542	38548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006366	GAG	2	6	38550	38555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006366	TTA	2	6	38643	38648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006366	GAATT	2	10	39378	39387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006366	CTA	2	6	39391	39396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006366	AGATG	2	10	39463	39472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006366	AAC	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006366	TAT	2	6	39525	39530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006366	CAA	2	6	39602	39607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006366	AAT	2	6	39613	39618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006366	TAAT	2	8	39658	39665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006366	TCATT	2	10	39670	39679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006366	GTT	2	6	39699	39704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006366	AATT	2	8	39719	39726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006366	GCC	2	6	41395	41400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_006366	TA	3	6	41481	41486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006366	ATC	2	6	41981	41986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006366	TCA	2	6	41987	41992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006366	A	6	6	41994	41999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006366	TAT	2	6	42016	42021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006366	ATT	2	6	42034	42039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006366	TAA	2	6	42125	42130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006366	CAAT	2	8	42138	42145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006366	TAT	2	6	42846	42851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006366	AAT	2	6	42869	42874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006366	TAAA	2	8	42887	42894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006366	AAC	2	6	42920	42925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006366	TCA	2	6	42946	42951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006366	GTA	2	6	42953	42958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006366	ATT	2	6	42997	43002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006366	TCA	2	6	43022	43027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006366	AATTT	2	10	43032	43041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006366	ATTT	2	8	43063	43070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006366	AG	3	6	43107	43112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006366	TTTATT	2	12	43113	43124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006366	TTAT	2	8	43133	43140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006366	TGC	2	6	43241	43246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006366	ATA	2	6	43269	43274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006366	AGA	2	6	43364	43369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006366	T	6	6	43393	43398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006366	T	7	7	43439	43445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006366	CGG	2	6	43687	43692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006366	GCT	2	6	43823	43828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006366	TGC	2	6	43980	43985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006366	AGAA	2	8	44029	44036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006366	AC	3	6	44082	44087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006366	CGG	2	6	44106	44111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006366	T	6	6	44113	44118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006366	TGC	2	6	44167	44172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006366	CCG	2	6	44203	44208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_006366	CTA	2	6	44281	44286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006366	ATT	2	6	44333	44338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006366	AT	3	6	44392	44397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006366	TTGCT	2	10	44514	44523	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_006366	TGG	2	6	44640	44645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006366	T	7	7	44652	44658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006366	GCT	2	6	44700	44705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006366	CAC	2	6	44827	44832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_006366	TTTA	2	8	44875	44882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006366	TACC	2	8	44931	44938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006366	ATT	2	6	44952	44957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006366	TTC	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_006366	ATT	2	6	58697	58702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.